Экипаж 134 ато был назначен для выполнения рейса №10 Хабаровск-Москва (со сменой в Иркутске).
    В 11:10 мск экипаж по распоряжению диспетчера КДП подрулил к аэровокзалу. Самолет был поставлен на перроне по ветру. В этот день на аэродроме был порывистый ветер со скоростью 20-24 м/с. После посадки пассажиров, в 11:45 КВС запросил разрешение выруливать на старт. Диспетчер КДП перед выдачей разрешения запросил, установлена ли струбцина на руль поворота. КВС доложил, что все струбцины сняты, и настойчиво просил разрешения рулить на старт без установки струбцин. Диспетчер категорически приказал установить струбцину. Через некоторое время КВС доложил о готовности к выруливанию на старт. Диспетчер, считая, что экипаж установил струбцину, дал разрешение выруливать. Самолет выруливал без струбцины, что подтверждают свидетели.
    На предварительном старте самолет находился 5 минут. Затем экипаж получил разрешение выруливать на исполнительный старт, доложил о проведении контроля согласно карты обязательных проверок и запросил разрешение на взлет. Получив его, в 11:58 мск экипаж произвел взлет с МК=52° при следующей фактической погоде: облачность 10 баллов, средняя, метель, видимость 4,5 км, ветер северо-восточный 20 м/с с порывами до 24 м/с, t=-13°С. После взлета экипаж на вопрос РП об условиях взлета не ответил. На вторичный запрос ответил: «не мешайте» и только через некоторое время сообщил, что «очень плохие, очень плохие». КВС подходившего к аэродрому Ил-12 №Л1346 видел борт №1309 не в направлении выхода из зоны АДС, а в направлении захода на посадку. В районе четвертого разворота Ил-12 №1309 медленным доворотом, почти без крена, начал выходить на ЛЗП. Показания позволяют сделать вывод, что КВС Лопатников после взлета обнаружил неисправность в органах управления, своевременно не доложил РП, пытаясь зайти на посадку, однако, в районе четвертого разворота передумал и принял решение продолжить полет.
    В 12:06 экипаж перешел на связь с ГКДП. В 12:24 с борта поступило сообщение, что отказало управление рулем поворота. На вопрос о решении КВС ответил, что будет следовать в Архару, т.к. «у вас садиться нельзя из-за сильного ветра». Диспетчер ГКДП доложил диспетчеру РДС Хабаровск, который передал затем указание РП следовать в Архару для посадки. При этом диспетчер РДС Хабаровска не принял необходимых мер для обеспечения контроля за полетом с помощью всех радиолокационных средств, имеющихся в аэропорту. В 12:35 экипаж передал о пролете Биробиджана в 12:32 на высоте 2 100 м. Диспетчер, не уточнив условий полета и характер отказа, дал распоряжение о переходе на связь по УКВ радиостанции, после чего связь с бортом была потеряна и на все вызовы экипаж не отвечал. Самолет пропал без вести и его поиски результатов не дали.